Уроженец Киева в 1998-2002 годах был играющим тренером "Беркута", после чего перебрался в Россию, где работал со второй командой ярославского "Локомотива" сначала в качестве ассистента, а затем – и главного тренера. В 2005 году Хоменко стал помощником тренера основной команды клуба.